新生儿医疗保险办理流程如下：
第一步，为新生儿办理入户手续；只有在新生儿取得本市户籍以后，才有资格参加婴儿医疗保险。
第二步，到当地的医保服务点为新生儿办理参保手续，同时缴纳相应的费用；在办理参保手续时，家长应向工作人员提供户口本、出生证等资料的原件和复印件。
第三步，领取门诊医疗的就医凭证；这个凭证包括《社会保障卡》和《就医记录册》。
第四步，领取住院医疗的就医凭证；这个凭证是指《少儿住院基金医疗证》。
新生儿出生三个月内就可以办理医保，在这个期间完成参保并缴纳费用的话，自宝宝出生起的医疗费用都可以得到报销。
