社保和农村合作医疗在覆盖对象、缴费标准、保障范围、缴费方式等方面有所区别：
1、覆盖对象：社保覆盖对象是城镇所有用人单位及其职工，包括企业机关、事业单位、社会团体等等；农村合作医疗覆盖对象就是农村户口人群。
2、保障范围：社保保障内容包括医疗保险、养老保险、工伤保险、生育保险、失业保险五个方面；农村合作医疗只能保障医疗保障，能报销门诊费用、住院费用，还有大病二次报销。
3、缴费标准：社保缴费等于缴费基数*缴费比例，与职工个人的工资水平有关；农村合作医疗每年都是统一缴费，一年只需要几百元。
4、缴费方式：社保是由单位和职工共同缴纳保费，按月缴纳；农村合作医疗由个人缴费，按年缴纳。
社保和农村合作医疗的差距还是比较大的，社保可以享受的各项待遇都比较好，而农村合作医疗只能享受基本医保待遇和大病报销待遇，大家根据自己的身份进行参保即可。
