北京京惠保和普惠保的不同之处包括：
1.两者的指导部门不同，北京京惠保的指导部门为北京市委社会工委市民政局、中关村科学城管理委员会和北京市大数据管理局；普惠保的指导部门为北京市医疗保障局和北京市地方金融监督管理局；
2.两者的保障内容有所不同，比如北京京惠保仅保障医保内住院医疗费用，但普惠保可以保障医保内外住院医疗费用；
3.两者的报销比例有所不同，北京京惠保的保险比例相对于普惠保来说要高一些。
