大额存单存在以下的缺点：
1、门槛较高
大额存单与活期存款相比较其门槛要高一些，一般来说，大额存单的最低起存金额为20万元。
2、灵活性较差
大额存单有一定的期限，提前支取将按照活期存款的利率计算收益，会让储户损失一部分利息收益。
3、限额发行
大额存单是按期发行的，每期发行的额度有限，这可能会导致储户买不上。
