1、有可能会亏本；
2、成交价过低，国债逆回购需要支付佣金，并且不同的逆回购天数收取的佣金不同，如果说在逆回购的时候成交价格过低，一旦遇到收入低于佣金的情况，那么这次就会亏本；
3、买卖时机不对，现在国债逆回购的计息天数已经变为了实际占用天数，假设在节假日之前操作了一笔3天期的逆回购，但实际占款天数只有1天，也就只计息一天；
4、券商软件的交易系统故障也可能导致亏损。
