国债逆回购手续费是统一的。但是，投资者也可以根据需求与自己的客户经理协商具体的手续费用；同时，一些券商也会有手续费优惠类的活动，投资者可以关注。一般来说，国债逆回购的成交额越大，投资者需要缴纳的手续费就越多，但是在国债逆回购的交易过程中，投资者只需要缴纳券商佣金，不需要缴纳印花税、过户费等其它手续费，成本相对还是较低的。
沪市和深市规定的债券回购手续费是一致的，具体如下：
①1天期，成交金额的0.001%；
②2天期，成交金额的0.002%；
③3天期，成交金额的0.003%；
④4天期，成交金额的0.004%；
⑤7天期，成交金额的0.005%；
⑥14天期，成交金额的0.010%；
⑦28天期，成交金额的0.020%；
⑧28天期以上，成交金额的0.030%。
国债逆回购赚钱方式：
国债逆回购的本质是一种短期贷款，投资者通过借出本金，获取利息赚钱。国债逆回购收益的计算方法为：国债逆回购收益=（资金×利率×实际占款天数/365）-（本金×佣金费率），其利率是投资者在购买国债逆回购时的票面利率。
一些大的机构在短期内缺钱的时候，会将自己持有的国债在市场上抵押出去以获得借款，到期还本付息，它们就是国债逆回购的回购方；投资者则是将自己的资金借出去，获得作为抵押物的国债，借款到期后收取本金和利息，归还国债给回购方。目前市场上的国债逆回购一共有18个品种，沪市、深市各9个，分别为1天期、2天期、3天期、4天期、7天期…182天期等。国债逆回购不同于存款，不是期限越长利率就越高的，相反有些时候期限长的可能利率还更低。投资者应该根据自己的资金流通要求和盈利预期挑选合适的国债逆回购产品进行交易。
国债逆回购门槛：
2022年5月16日，根据《上海证券交易所债券交易规则》新规，深交所债券交易单位由张变为100元面额，上交所国债逆回购交易门槛由10万元降为1000元。新规后，无论是上交所还是深交所，国债逆回购的最低购买金额都是1000元，购买金额按照1000的整数倍递增，最大数量为100亿元面额。经过这次调整，降低了上交所的准入门槛，上交所和深交所的国债逆回购在申报门槛和价格最小变动单位等方面就达成了统一，有利于活跃市场，平衡国债逆回购的利率。
